1947年11月，經沈鈞儒和民盟中央主席張瀾密商，沈鈞儒、章伯鈞、周新民等秘密離開上海到達香港，與原來在香港的中央委員會合，醞釀恢復民盟總部。

1948年1月5日至19日，中國民主同盟第一屆中央委員會第三次全體會議在香港召開，參加會議的共29人，地方支部代表12人列席。

會議通過了《三中全會緊急聲明》《三中全會政治報告》《三中全會宣言》《今后組織工作計劃》等決議案，決定恢復臨時總部，制定了和中國共產黨密切合作，聯合各民主黨派和無黨派民主人士，為徹底摧毀南京國民黨反動政府，實現民主、和平、獨立、統一的新中國而奮斗到底的政治路線。這是中國民主同盟的歷史轉折，它公開宣布今后要和共產黨攜手合作，采取“革命的立場”，反對中立的態度和所謂中間路線。

三中全會對民盟總部領導機構作了調整充實，由沈鈞儒、章伯鈞以民主同盟中常委名義領導全盟工作。會議期間，香港的同志和留在上海的張瀾、羅隆基等始終保持著密切聯系。沈鈞儒在閉幕詞中宣布：“接到上海同志們的來信，他們和我們完全采取了共同一致的意見，這是開會中值得我們驕傲的。”

三中全會閉幕后，民盟總部號召全體盟員以實際行動實現三中全會提出的政治任務。2月在香港召開記者招待會，沈鈞儒向記者和民主人士說明了民盟新的政治路線和斗爭目標。接著，民盟總部發出通告，要求各級組織“必須堅決地反對南京獨裁政府，反對美國援蔣侵華政策，反對封建剝削制度”，“并與一切民主黨派尤其是中共及國民黨民主派攜手合作，以加強民主統一戰線”。

一屆三中全會以后經過近一年的工作，民盟在國統區先后恢復并新建了華東區、華南區、華中區、西南區、西北區等地方組織。1948年2月，在上海建立了民盟華東執行部，辛志超任主任，同年7月辛志超赴華北后，由史良代理主任一職。她在“白色恐怖”下從事民盟地下工作，宣傳民主，保護民盟組織，還在經濟上資助民盟上海地下支部。

港九與各海外支部也積極聲援祖國人民的解放戰爭，支援受國民黨迫害的民主人士。胡愈之領導的民盟馬來亞支部，在斗爭中發展盟員3000余人。

同時，民盟也開始在解放區建立和發展組織。1948年10月，民盟華北解放區聯絡處在石家莊成立。11月，胡愈之、吳晗、嚴信民等6人在李家莊成立了民盟華北解放區第一小組；之后，又在河北省正定縣成立了華北解放區第二小組。1949年5月，原西北總支部委員楊明軒、李敷仁等也在延安成立了西北工作委員會。

此外，民盟總部、南方總支部和港九支部還配合中共創辦達德學院。1946年秋，為傳播馬列主義、為新中國培養干部，中共南方局決定在香港創辦一所高等學府。民盟總部、南方總支部和港九支部積極配合，由丘哲任籌備主任負責籌措經費。這所學府定名為達德學院，設政治、經濟、文學等系和新聞專修班，民盟許多著名學者如黃藥眠、鄧初民、沈志遠等參加教學工作，先后培養了200多名學生。